Les éléments de diagnostic du patrimoine naturel et des activités humaines présents sur le site de la Tourbière de Négarioux-Malsagne mettent en évidence les éléments suivants :
- Un site caractéristique des formes de relief rencontrées sur le Plateau de Millevaches, c'est à dire une alvéole au fond tourbeux, entouré de versants agricoles aux sommets boisés.
- Une colonisation des landes sèches par les essences ligneuses.
- Une bonne qualité de l'eau liée à la localisation du site en tête de bassin.
- Une charge agropastorale inégalement répartie sur le site.
Le maintien de la qualité de l'eau, la préservation des habitats d'espèces, la restauration des habitats naturels, l'amélioration des connaisances et une meilleure valorisation du site sont les enjeux majeurs de l'animation Natura 2000 de ce site.
Différentes menaces et pressions potentielles ont été identifiées sur ce site :
| Menaces | Type | Ampleur | Localisation |
| Abandon de systèmes pastoraux, sous pâturage | Négative | Moyenne | Intérieur du site |
| Pâturage extensif | Positive | Moyenne | Intérieur du site |
| Sylviculture et opérations forestières | Négative | Faible | Int. et ext. du site |
| Chasse | Non évaluée | Faible | Int. et ext. du site |
| Canalisation et dérivation des eaux | Négative | Faible | Int. et ext. du site |
| Captage des eaux de surface | Négative | Faible | Int. et ext. du site |
| Extraction de tourbe | Négative | Faible | Intérieur du site |
| Modification de la composition spécifique (succession) | Non évaluée | Faible | Intérieur du site |
| Changements des conditions hydrauliques induits par l'homme | Non évaluée | Faible | Int. et ext. du site |
| Réduction ou perte de caractéristiques d'un habitat | Non évaluée | Faible | Int. et ext. du site |
Fragmentation des habitats par une action anthropique | Non évaluée | Faible | Int. et ext. du site |
| Colonisation naturelle d'espèce | Non évaluée | Faible | Int. et ext. du site |